Application note - Modernstes Biobanking für
Bioproben mit dem Schwerpunkt Onkologie
BioBank Dresden
Abstract
Die BioBank Dresden (BBD), lokalisiert am Universitätsklinikum Dresden / der Medizinischen Fakultät der Universität Dresden, agiert in enger Kooperation mit dem Deutschen Krebsforschungszentrum (DKFZ) und dem Nationalen Zentrum für Tumorerkrankungen Dresden (NCT). Sie unterstützt die Forschung auf dem Gebiet der Humanmedizin, insbesondere im
Bereich der Krebsforschung. Die aus den Kliniken transferierten Patientenproben werden entsprechend gültiger Richtlinien und Laborstandards mittels Robotiksystemen aufbereitet. Nach der Zellisolation erfolgt so die Überführung in LVL SAFE® 2D Tubes, worin die Proben dem automatischen Einfrierprozess und der Kryokonservierung im automatischen Lagersystem zugeführt werden und so für die selektive Nutzung in der Forschung zur Verfügung stehen.
Sowohl die hohe und langfristig stabile Produktqualität der LVL SAFE® 2D Tubes als auch das anwendungsfreundliche und mit Geräten und Lagerungssystemen kompatible Produktdesign sind Garanten für einen sicheren Prozess. Die Kombination von maschinen- und individuellen menschenlesbaren Codes optimiert die Praktikabilität in der Biobank und in den Forschungsprojekten.
Die BioBank Dresden ist eine Klinikum-integrierte Biobank. Innerhalb der Biobank werden qualitätsgesichert und datenschutzkonform Bioproben von Patienten und gesunden Probanden aufgearbeitet und gelagert. Die Gewebe- und Flüssigproben werden im Kontext der Routinediagnostik und -therapie aus Operationen, Biopsien, Punktionen, Blut- oder Urinabnahmen gewonnen und nach Einwilligung der Patienten in die BioBank Dresden transferiert. Aktuell verwaltet die BioBank über 100.000 Bioproben. Ein Ausbau der Infrastruktur, um die Lagerkapazitäten auf über 5 Mio. Bioproben zu erhöhen, ist gestartet.
Die Akkreditierung nach DIN EN ISO 20387 erfolgt in Kürze.
Mit Ihrer Probensammlung unterstützt die BioBank Dresden zahlreiche Forschungsprojekte und leistet damit einen wichtigen Beitrag, Krankheiten besser zu verstehen, effizienter zu therapieren und zu heilen.
Es werden Bioproben von verschiedenen Erkrankungen verwaltet und der Forschung zur Verfügung gestellt. Dazu gehören beispielhaft Patientenproben von gastrointestinalen Tumoren, Lymphomen, dermatologischen Karzinomen, urologischen Tumoren, aber auch von nichtonkologischen Erkrankungen wie der Immunthrombozytenpenie, Covid-19 oder neurologischen Erkrankungen. Die bisher von Wissenschaftlern untersuchten Proben führten zu Erkenntnisgewinn und Veröffentlichungen in Fachjournalen.
- Einsenden von Gewebe- und Flüssigbioproben wie Blut, Urin, Serum, Knochenmark und Liquor in die Biobank in großen Monovetten
- Innerhalb kürzester Zeit nach Probeneingang: vollautomatisierte Probenaliquotierung und Zellisolation sowie Überführung in LVL SAFE® 2D Tubes in Robotiksystemen
- Unmittelbares kontrolliertes Einfrieren der Proben in den LVL SAFE® 2D Tubes von Raumtemperatur auf –100 °C; Anlegen des Einfrierauftrags für die automatische Lagerung an der Einfrierrobotik
- Transfer der Racks mit den eingefrorenen Proben in sicheren Transportsystemen in der Gasphase von Flüssigstickstoff zum Lager, stets unter Wahrung der Kühlkette
- Vollautomatisierte Einlagerung der Proben in Tanks in der Gasphase von Flüssigstickstoff nach Prüfung der 2D-Codes; Robotik-gesteuerte Lagerung bei Temperaturen von –150 °C bis zu –185 °C
- Probenauswahl für Analysen im Rahmen von wissenschaftlichen Projekten entsprechend ethischer und wissenschaftlicher Regularien
- Datenbankgesteuerte Selektion, Barcode-spezifisches Picking der relevanten Tubes und deren Auslagerung aus dem automatischen Lager – Bereitstellung der Proben für die Wissenschaftler in Racks
- Den LVL-Codes werden während der Prozesse alle relevanten Informationen zugeordnet, einschließlich Probeninhalt, Lagerort, Aufarbeitungsinformationen u. Ä.
- Das Scannen und Auslesen der Tube- und Rack-Codes erfolgt vollautomatisch sehr einfach mit dem LVL SAFE® Tube und Tube Rack READER, sowohl für einzelne Tubes als auch für ganze Racks mit Tubes – Übertragung der Codes über die kompatible Schnittstelle in das bestehende Sample Management System.
Eingesetzte Produkte von LVL technologies
LVL SAFE® 2D Tubes: SX 300 (DNA, RNA), MX 500 (Plasma, Serum, Liquor, Buffy-Coat), LX 1000 (Urin, Zellen, Cell-free DNA-Plasma)
Die Tubes werden mit einem weiteren Barcode und einem menschenlesbaren Code, zusätzlich zum standardmäßigen maschinenlesbaren 2D-Code, bedruckt und geliefert.
Geräte: LVL SAFE® Tube und Tube Rack READER
Gemeinsames Pilotprojekt für Recycling genutzter Racks
- Ziel: nachhaltigere Produktnutzung und Kostenersparnis
- Aktueller Praxistest von 100 % recycelten Racks
(Rack, Rackdeckel und Verschlusssystem des Racks)
Webseite
https://tu-dresden.de/med/mf/forschung-internationales/forschungsunterstuetzung/biobank-dresden
Infofilm
https://videocampus.sachsen.de/video/infofilm-biobank-dresden/4330a6817af71910c1251b462e0ae680
Publikation zu technischen Details und Validierungsdaten
Next Generation Biobanking: Employing a Robotic System for
Automated Mononuclear Cell Isolation
https://www.liebertpub.com/doi/10.1089/bio.2021.0181